员工离职时公司扣工资，多数情况下属违法行为，但具体处理需看实际情形。若公司无合法理由扣工资，员工有权依法维权。具体如下：1.无合法理由扣工资：员工可依法追讨全额工资，可通过投诉或仲裁。2.未完成工作交接：公司可依《劳动合同法》暂扣部分工资，但不能全扣。3.违反制度或造成损失：公司可依法扣除相应赔偿，但不得超法定比例。4.协商一致：员工同意前提下，扣减工资可视为双方协商结果，但需书面协议。5.存在争议：员工需收集证据，在法定时效内申请劳动仲裁维权。
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员工离职时公司扣工资，可能面临以下法律风险：1.诉讼时效风险：如离职后三个月才发现被非法扣薪，六个月后才申请仲裁，已超一年仲裁时效，可能无法追回工资。2.证据链风险：如主张公司无理扣薪，却无法提供劳动合同、工资条或沟通记录等关键证据，仲裁机构可能不支持。3.经济损失风险：如公司非法扣减5000元月工资，未及时维权可能导致无法追回，造成实际损失。
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员工离职时公司扣工资是否违法，需结合法律依据判断。《中华人民共和国劳动法》第五十条明确：“工资应以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或无故拖欠。”《中华人民共和国劳动合同法》第三十条也规定：“用人单位应按劳动合同约定和国家规定，及时足额支付劳动报酬。”可见，公司无正当理由扣减工资属违法。若员工已履行工作职责并完成离职交接，公司仍扣工资，员工可依法申请劳动仲裁要求支付。若公司主张员工造成损失或未完成交接，需提供充分证据证明扣薪合法性，且扣减比例不得超法定标准（如不超过员工月工资的20%）。综上，公司离职扣薪必须有合法依据和程序，否则违法，员工可依法维权。
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员工离职时公司扣工资的处理，可能受以下特殊情况影响：1.未完成工作交接：员工未按规定完成交接，公司可依内部制度或劳动合同约定，合法暂扣部分工资，但不能全扣。2.造成经济损失：员工离职前因工作失误致公司损失，公司可依法扣除相应工资作为赔偿，但需提供有效证据并受法定比例限制。3.存在协商协议：如员工与公司达成一致（如离职协议中明确工资调整条款），可能影响员工后续主张工资的权利。这些特殊情况会直接影响工资追回及维权难度、成功率。建议处理前充分评估情况，您也可以咨询我为您提供解答。

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